Tout juste débarquée à Paris, la jeune juge d'instruction Nadia Lintz comprend qu'elle devra batailler ferme pour tenir tête à l'inspecteur Rovère. Celui-ci, qui enquête sur une affaire de parricide que va instruire Nadia, ne goûte guère les directives et entend mener l'enquête comme bon lui semble. La jeune femme doit alors faire preuve d'une extrême fermeté pour ne pas lâcher prise. Une affaire de révisionnisme réveille en elle de douloureux souvenirs : l'honneur de sa famille n'est-il pas entaché par les faits de collaboration dont son père s'est rendu coupable durant la guerre ? Justement, sa mère et son ex-mari viennent lui annoncer que celui-ci, sachant sa mort prochaine, la réclame à son chevet...

Le cadavre d'un homme, qu'aucun papier ne peut identifier, est découvert sur un terrain vague. Sa mort semble avoir été causée par un coup violent au crâne. L'équipe du commandant Rovère découvre qu'il s'agit du capitaine Luc Fomey, élève de la prestigieuse Ecole supérieure des armées. L'autopsie révèle que le trentenaire avait pris des drogues et que le coup a été porté post-mortem : l'assassin a voulu faire croire à une agression. Alors que Rovère s'intéresse à Greg, un jeune homme aperçu avec la victime le soir du meurtre, le juge Nadia Lintz tente d'interroger les militaires proches de la victime, mais ceux-ci ne sont guère loquaces...

Serge, un écrivain de 43 ans, est retrouvé mort juste à côté de Julien, un jeune homme que tout semble accuser. Quelles sont les circonstances précises de ce drame ?

Laura, une mère de famille, est retrouvée blessée à la tête dans son appartement de Nantes. Depuis quelque temps, elle avait beaucoup changé. Son agression a-t-elle un lien avec sa nouvelle vie ? Qui a bien pu s'en prendre à la jeune femme ?

Alors que la presse a dévoilé l'existence d'un nouveau tueur en série, les habitants deviennent paranoïaques. Les spécialistes suivent une nouvelle affaire et se rendent à la morgue...

Crews et Reese enquêtent sur la mort de trois Russes. Deux d'entre eux faisaient partie de la mafia tandis que le troisième, Pavel, était un génie en informatique. Leurs investigations les mènent à Liza, la petite amie de Pavel, puis à Roman Nevikov, qu'ils soupçonnent bientôt du triple meurtre. Par ailleurs, Crews a également chargé un de ses anciens codétenus de veiller sur Ted en prison. Ensuite, croyant surprendre un cambrioleur chez lui, il tire sur son père, qui venait lui remettre son invitation de mariage. Il doit également se séparer de Rachel le temps de l'enquête à cause de menaces proférées par Roman...

L'agriculteur Bus Carter est bien décidé à se débarrasser du troupeau de mustangs qui erre dans les plaines d'Arizona et détruit ses cultures. Mais deux Indiens de la région, inquiets pour l'avenir de l'espèce, sollicitent l'aide de l'Agence...

Olivia Dubois, une étudiante sans histoire, a été assassinée, frappée de sept coups de couteaux. Sa grand-mère refuse de parler aux forces de l'ordre. Son ex-fiancé, qui fait partie des suspects, n'a qu'un alibi fragile pour la nuit du crime. Quelqu'un harcelait la jeune femme au téléphone. Dans son carnet, Olivia possédait le numéro du juge Nadia Lintz. Autant d'éléments qui laissent perplexe le commandant Rovère, qui parvient néanmoins à mettre en évidence une relation amoureuse à trois entre Olivia, un certain Bertrand et Costini, un professeur de droit dont la maîtresse fait partie d'un mouvement fasciste, les Anneaux de Nibelungen. Un livre, «Les Murmures de la forêt», pourrait contenir la solution de l'énigme...

Pierre, un médecin de 62 ans, est retrouvé mort dans le placard de son cabinet médical. Est-il possible que le meurtrier soit un de ses patients, ou peut-être un de ses proches ?

Baptiste, directeur d'une usine de peinture, est laissé pour mort après avoir été violemment frappé à la tête. Trois personnes de son entourage sont dans le collimateur de la police.

Jerome Turner, admis à l'hôpital après avoir été poignardé, meurt sans avoir eu le temps d'expliquer ce qui lui était arrivé. La victime, originaire du Bronx, portait sur elle ses alliances, ses clés de voiture et la somme de 800 dollars. Lupo et Bernard, chargés de mener l'enquête, questionnent sa femme, qui l'a vu pour la dernière fois dans l'après-midi précédant sa mort. Ils lui montrent les clés de voiture retrouvées sur lui, qu'elle ne reconnaît pas. Plus tard, les enquêteurs apprennent que Turner ne s'est pas rendu à son travail le jour de sa mort...

Cela va faire plusieurs semaine que Crews a été blessé par balles sur le pas de sa porte. Il est encore convalescent et reste partiellement amnésique, incapable de se souvenir du visage de celui qui lui a tiré dessus. Parallèlement, il se voit confier une nouvelle mission. En compagnie de Reese, il doit enquêter sur la mort suspecte d'un ancien astronaute de la Nasa, qui a dû poser son avion dans un quartier résidentiel. Ils apprennent que la victime était sur le point de vendre sa compagnie pour s'offrir un dernier voyage dans l'espace. Son fils et son associé, ancien astronaute lui aussi, risquaient de se retrouver au chômage...

Reese et Crews enquêtent sur le meurtre du chanteur d'un groupe de rock. Il a visiblement été étouffé à l'aide d'une pièce de plastique, qui a formé une sorte de masque mortuaire retrouvé sur les lieux. Le groupe commençait à avoir du succès et des fans de plus en plus nombreux se pressaient pour assister aux concerts. Les inspecteurs apprennent que la victime n'était membre du groupe que depuis un an et que son prédécesseur avait été renvoyé par les musiciens. L'enquête au sein de la foule qui adule le groupe est laborieuse, les principaux indices étant les photos prises pendant les concerts...

Transformés en cow-boys masqués, les membres de l'Agence se lancent à l'assaut d'un train censé transporter des mustangs au Mexique. Furieux de ce contretemps, Bus et ses hommes de main décident de prendre une solide revanche...

Le tueur en série a encore frappé, mais cette fois-ci, les spécialistes ont trouvé une tache de sang de l'assassin sur la victime. Après analyse, ils s'aperçoivent que le tueur en série prend des médicaments antipsychotiques...

Le baron de Castayrac, producteur d'armagnac, voit ses chais ravagés par les flammes. Le corps carbonisé de Paco Vasquez, son maître de chai, est retrouvé dans les décombres. La compagnie d'assurance chargée de l'indemniser lui envoie Benjamin Lebel, qui découvre bientôt qu'il s'agit d'un incendie criminel, et non pas d'une défaillance humaine, comme l'avait conclu l'enquête. Benjamin constate également que les comptes du baron sont bien loin de ceux de son expertise. Il est confronté là à un dossier épineux, d'autant qu'une lutte fratricide semble déchirer le clan Castayrac. Dans ce climat de tensions extrêmes, Benjamin Lebel est entraîné dans une véritable course contre la montre. Il lui faut découvrir au plus vite la vérité, afin d'éviter une nouvelle tragédie...

A Narbonne, Christophe Hondelatte plonge dans l'univers semi-carcéral d'un centre éducatif fermé : jour et nuit, 24 éducateurs encadrent 12 garçons, des mineurs multirécidivistes, qui font l'objet d'une mesure de contrôle judiciaire ou de sursis avec mise à l'épreuve. Durant plusieurs jours, le journaliste partage le quotidien de ces jeunes délinquants, qui ont échappé de justesse à l'incarcération au profit de cette alternative, qui se veut plus douce. Dans leur cas, toutes les mesures éducatives ont échoué. A la moindre incartade, ils risquent de passer par la case prison.

C'est à Quiberon, dans le Morbihan, que Christophe Hondelatte a choisi de poser son ciré. Au programme, une nouvelle semaine en immersion totale au côté de gens ordinaires qui exercent des métiers ou des activités hors du commun. Cette fois, le journaliste part à la rencontre de passionnés de la mer, qui risquent leur vie durant leur temps libre pour sauver celle des autres. Pompiers, maçons ou encore pêcheurs, les sauveteurs en mer interviennent gratuitement pour secourir les nageurs, surveiller les plages, ou agir sur le lieu d'un accident. 24h sur 24, 365 jours, la station est en alerte. Pendant plusieurs jours, l'animateur partage le quotidien houleux de ces bénévoles, dévoués et courageux.

Retour sur l'affaire Peter Chapmann, délinquant sexuel récidiviste qui utilisait Internet pour traquer ses victimes et tromper la surveillance de la police.

Véra Cabral, psychiatre urgentiste, est appelée en catastrophe au quartier des femmes de la prison de Fleury-Mérogis. Une prise d'otages est en cours. Véra intervient et parvient à dénouer la crise, mais ne peut pas empêcher Giselle, la preneuse d'otages, de tuer une gardienne. La psychiatre ne comprend pas ce qui a pu pousser Giselle à commettre un tel acte. N'était-elle pas à seulement une semaine de sa libération ? A présent, ses chances de sortir de prison et de se réinsérer sont anéanties. Véra aimerait en savoir plus sur les circonstances de la prise d'otages, car de nombreux détails lui paraissent troublants. Elle espère convaincre le juge de la laisser enquêter...

La vie de Véra Cabral semble définitivement entachée par les événements de Fleury. Mais l'audacieuse psychiatre urgentiste ne se résout pas à rester dans l'ignorance. Elle plonge alors dans une histoire familiale devenue tortueuse depuis la guerre d'Algérie. Elle sympathise avec Hakim Salem, un policier algérien, sans se douter qu'il enquête lui aussi sur la détenue de Fleury. D'après lui, Giselle aurait eu un enfant avec le terroriste qu'il recherche. Mais les indices dont chacun dispose permettront-ils de comprendre ce qui se cache derrière les apparences ?...

Près de Lille, Olivier, un informaticien de 33 ans, et poignardé dans un salon de coiffure. A-t-il été victime d'un geste impulsif, ou d'un assassinat prémédité par une personnage de son entourage ?

Serge, un écrivain de 43 ans, est retrouvé mort juste à côté de Julien, un jeune homme que tout semble accuser. Quelles sont les circonstances précises de ce drame ?

Toute l'équipe ne croit pas à la théorie de Venturi, qui soutient qu'un nouveau tueur en série est en activité. De Biase s'occupe d'un accident de la route et Francesca enquête sur la mort d'une femme au foyer...